MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 53839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007974	CGA	2	6	972	977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
2	NC_007974	ATC	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314736
3	NC_007974	CGA	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
4	NC_007974	GCC	2	6	1188	1193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314736
5	NC_007974	TGA	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314736
6	NC_007974	GCA	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
7	NC_007974	CGGC	2	8	1278	1285	0 %	0 %	50 %	50 %	94314736
8	NC_007974	AAG	3	9	1378	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94314736
9	NC_007974	G	6	6	1482	1487	0 %	0 %	100 %	0 %	94314736
10	NC_007974	CAG	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
11	NC_007974	GTT	2	6	1530	1535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94314736
12	NC_007974	CGA	2	6	1541	1546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314736
13	NC_007974	ATCG	3	12	1608	1619	25 %	25 %	25 %	25 %	94314736
14	NC_007974	TGG	2	6	1654	1659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314736
15	NC_007974	GTG	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314736
16	NC_007974	TGCG	2	8	1760	1767	0 %	25 %	50 %	25 %	94314736
17	NC_007974	CTT	2	6	1827	1832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314736
18	NC_007974	GCG	2	6	1842	1847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314736
19	NC_007974	GAGC	2	8	1899	1906	25 %	0 %	50 %	25 %	94314736
20	NC_007974	TTC	2	6	1983	1988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314736
21	NC_007974	CAC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314737
22	NC_007974	GCA	2	6	2771	2776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314738
23	NC_007974	ATC	2	6	2780	2785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314738
24	NC_007974	GGC	2	6	2804	2809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314738
25	NC_007974	CAGT	2	8	2823	2830	25 %	25 %	25 %	25 %	94314738
26	NC_007974	TGG	2	6	2877	2882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314738
27	NC_007974	CGA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314738
28	NC_007974	ATC	2	6	3098	3103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314738
29	NC_007974	CGC	2	6	3117	3122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314738
30	NC_007974	GCC	2	6	3143	3148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314738
31	NC_007974	GCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314738
32	NC_007974	TGA	2	6	3262	3267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314738
33	NC_007974	ATG	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314738
34	NC_007974	CG	3	6	3516	3521	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
35	NC_007974	GGC	2	6	3528	3533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314739
36	NC_007974	GC	4	8	3568	3575	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
37	NC_007974	CGC	2	6	3581	3586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314739
38	NC_007974	TGA	2	6	3609	3614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314739
39	NC_007974	CGC	2	6	3685	3690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314739
40	NC_007974	CGG	2	6	3701	3706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314739
41	NC_007974	GC	3	6	3717	3722	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
42	NC_007974	CCGAC	2	10	3770	3779	20 %	0 %	20 %	60 %	94314739
43	NC_007974	GC	3	6	3822	3827	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
44	NC_007974	GACC	2	8	3870	3877	25 %	0 %	25 %	50 %	94314739
45	NC_007974	TCCT	2	8	3904	3911	0 %	50 %	0 %	50 %	94314739
46	NC_007974	AGC	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314739
47	NC_007974	AGG	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314739
48	NC_007974	CGGC	2	8	4028	4035	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
49	NC_007974	CAA	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94314739
50	NC_007974	CG	3	6	4172	4177	0 %	0 %	50 %	50 %	94314739
51	NC_007974	CAT	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314739
52	NC_007974	ACG	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314739
53	NC_007974	GGAAG	2	10	4248	4257	40 %	0 %	60 %	0 %	94314739
54	NC_007974	GCC	2	6	4280	4285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314739
55	NC_007974	ACCG	2	8	4372	4379	25 %	0 %	25 %	50 %	94314739
56	NC_007974	CTG	2	6	4396	4401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314739
57	NC_007974	ACGTCG	2	12	4551	4562	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	94314740
58	NC_007974	ATCCC	2	10	4706	4715	20 %	20 %	0 %	60 %	94314740
59	NC_007974	GTCC	2	8	4745	4752	0 %	25 %	25 %	50 %	94314740
60	NC_007974	AGC	3	9	4827	4835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314740
61	NC_007974	CGA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314740
62	NC_007974	CGAG	2	8	4920	4927	25 %	0 %	50 %	25 %	94314740
63	NC_007974	GCC	2	6	4938	4943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
64	NC_007974	GTG	2	6	4960	4965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314740
65	NC_007974	GCCAG	2	10	4984	4993	20 %	0 %	40 %	40 %	94314740
66	NC_007974	GGA	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314740
67	NC_007974	CAT	2	6	5059	5064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314740
68	NC_007974	CGC	2	6	5071	5076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
69	NC_007974	GC	3	6	5122	5127	0 %	0 %	50 %	50 %	94314740
70	NC_007974	CGC	2	6	5141	5146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
71	NC_007974	GCC	2	6	5182	5187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314740
72	NC_007974	CCGG	2	8	5208	5215	0 %	0 %	50 %	50 %	94314740
73	NC_007974	ATG	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314740
74	NC_007974	TGC	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
75	NC_007974	TTC	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314740
76	NC_007974	GAT	2	6	5606	5611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314740
77	NC_007974	CCA	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314740
78	NC_007974	GGTC	2	8	5677	5684	0 %	25 %	50 %	25 %	94314740
79	NC_007974	GTC	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
80	NC_007974	TCGA	2	8	5793	5800	25 %	25 %	25 %	25 %	94314740
81	NC_007974	TGC	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
82	NC_007974	TCG	5	15	5958	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314740
83	NC_007974	ACG	2	6	6033	6038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314740
84	NC_007974	GGC	2	6	6065	6070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314740
85	NC_007974	GTGACA	2	12	7293	7304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94314741
86	NC_007974	GCG	2	6	7309	7314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
87	NC_007974	GCC	2	6	7339	7344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
88	NC_007974	ATC	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314741
89	NC_007974	TGG	2	6	7392	7397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314741
90	NC_007974	CGC	2	6	7399	7404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
91	NC_007974	CGC	2	6	7429	7434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
92	NC_007974	GCA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
93	NC_007974	GGCC	2	8	7486	7493	0 %	0 %	50 %	50 %	94314741
94	NC_007974	TGCGA	2	10	7512	7521	20 %	20 %	40 %	20 %	94314741
95	NC_007974	GCC	2	6	7523	7528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
96	NC_007974	TCT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94314741
97	NC_007974	CGA	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
98	NC_007974	ATC	2	6	7652	7657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94314741
99	NC_007974	CCT	2	6	7668	7673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94314741
100	NC_007974	CGA	2	6	7699	7704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
101	NC_007974	GCA	2	6	7744	7749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
102	NC_007974	CGC	2	6	7767	7772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
103	NC_007974	CG	3	6	7794	7799	0 %	0 %	50 %	50 %	94314741
104	NC_007974	TGG	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94314741
105	NC_007974	GCC	2	6	7889	7894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
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107	NC_007974	GGC	2	6	7972	7977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
108	NC_007974	GCG	2	6	8024	8029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
109	NC_007974	AAC	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94314741
110	NC_007974	CGC	2	6	8238	8243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
111	NC_007974	GCA	2	6	8296	8301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
112	NC_007974	GC	5	10	8330	8339	0 %	0 %	50 %	50 %	94314741
113	NC_007974	GGC	2	6	8347	8352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
114	NC_007974	GGA	2	6	8371	8376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314741
115	NC_007974	CGTCC	2	10	8378	8387	0 %	20 %	20 %	60 %	94314741
116	NC_007974	CTG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314741
117	NC_007974	CCAT	2	8	8445	8452	25 %	25 %	0 %	50 %	94314741
118	NC_007974	CTG	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314741
119	NC_007974	CGC	2	6	8582	8587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
120	NC_007974	GGC	2	6	8611	8616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
121	NC_007974	TTGC	2	8	8618	8625	0 %	50 %	25 %	25 %	94314741
122	NC_007974	CAG	2	6	8645	8650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314741
123	NC_007974	TG	3	6	8684	8689	0 %	50 %	50 %	0 %	94314741
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125	NC_007974	GACC	2	8	8701	8708	25 %	0 %	25 %	50 %	94314741
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128	NC_007974	CG	3	6	8836	8841	0 %	0 %	50 %	50 %	94314741
129	NC_007974	TC	3	6	8912	8917	0 %	50 %	0 %	50 %	94314741
130	NC_007974	CGAG	2	8	8983	8990	25 %	0 %	50 %	25 %	94314741
131	NC_007974	CCTT	2	8	9027	9034	0 %	50 %	0 %	50 %	94314741
132	NC_007974	CGC	2	6	9126	9131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94314741
133	NC_007974	TC	3	6	9157	9162	0 %	50 %	0 %	50 %	94314741
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135	NC_007974	GCG	2	6	9183	9188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314741
136	NC_007974	GCTG	2	8	9198	9205	0 %	25 %	50 %	25 %	94314741
137	NC_007974	GAG	2	6	9224	9229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94314741
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139	NC_007974	CTGG	2	8	9271	9278	0 %	25 %	50 %	25 %	94314741
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143	NC_007974	GCAG	2	8	9561	9568	25 %	0 %	50 %	25 %	94314741
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252	NC_007974	ACC	2	6	14072	14077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314745
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255	NC_007974	TGCG	2	8	14301	14308	0 %	25 %	50 %	25 %	94314746
256	NC_007974	CAC	3	9	14345	14353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94314746
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261	NC_007974	TCC	2	6	14580	14585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94314746
262	NC_007974	ATG	2	6	14607	14612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94314746
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264	NC_007974	CGA	2	6	14674	14679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94314746
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266	NC_007974	GGC	2	6	14704	14709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94314746
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392	NC_007974	TCG	2	6	21531	21536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94314752
393	NC_007974	GC	3	6	21542	21547	0 %	0 %	50 %	50 %	94314752
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